微生物在自然界中的分布非常广泛，与人类的关系也很密切。很多食品的制作离不开微生物的发酵，如制酸奶要用到乳酸杆菌，制豆腐乳要用毛霉、米曲霉，制醋要用到醋酸杆菌，制酒要用到酵母菌，甲烷细菌发酵还能产生沼气等。