胃肠功能紊乱主要是通过用药以及饮食调养、运动等方法来治疗。有胃肠功能紊乱的症状，可以遵医嘱服用整肠生或者双歧杆菌三联活菌，曲美布汀等药物治疗，平时一定要注意保养。胃肠功能紊乱可能和不良的饮食习惯或者精神生活压力过大，胃炎等有关系，一定要保持三餐规律饮食，减缓生活和工作中的压力，多参加一些有意义的娱乐活动，适当参加一些有氧的户外运动。吃饭以后不要马上坐着，也不要马上剧烈的运动，饭后一小时以后可以适当运动，多吃一些有养胃、益胃作用的食物。