肝管结石可以发生于肝内和肝外，与局部有可能发生的肝癌和胆管癌相关性尚不明确。胆管癌和胆管细胞性肝癌发病原因可能和胆道的慢性感染有关，结石引起的急慢性炎症可能是致癌因素，肝管结石会容易出现的病变是引起胆管炎和胆道梗阻，出现腹痛、黄疸和发热，结石体积较大的、有引起胆道炎症的需要进行手术治疗，手术可选择胆管探查取石术或部分肝叶切除术。

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