临床上胃肠功能紊乱多半是与一些不良的饮食习惯如暴饮暴食、长期的进食辛辣刺激，寒凉一些食物，饮食不规律或者经常性的饮酒有关。此外，有时也与服用一些相关的药物，如经常性的服用一些抗生素或者是一些刺激胃肠道的药物都可能会引起胃肠功能紊乱。

　　除此以外，也见于一些胃肠道的器质性疾病，如慢性胃炎、消化性溃疡、肠道炎症性肠病，这些疾病都可能会引起胃肠功能紊乱如腹泻、腹胀，恶心反胃的一些表现。此外，还有一些全身性疾病，如糖尿病的酮症酸中毒、糖尿病胃肠神经病变或者是甲状腺功能亢进等内分泌疾病、风湿系统结缔组织病等都会累及到胃肠道，引起胃肠功能的紊乱。