男性生殖器疼痛如果是在勃起时候发生，常见的原因是阴茎硬结症，因为阴茎海绵体受损后局部纤维组织增生造成。因为阴茎海绵体内有瘢痕形成，阴茎勃起时就会造成牵拉，引起勃起疼痛以及阴茎弯曲、畸形等情况的发生。如果是生殖器表面疼痛，而且局部伴有发红、水肿的现象，这要考虑是炎症感染引起的，特别是包皮过长、包茎的患者，疼痛会更加明显。还要考虑是精索静脉曲张、睾丸附睾炎、慢性前列腺炎等疾病导致的放射性疼痛，当然也不排除是外伤导致的疼痛，比如外力直接作用于阴囊或者阴茎部位，这时候会伴有肿胀甚至皮下出血的现象。