自身免疫性甲状腺炎是容易引起甲减的一个非常常见的疾病。临床上比较常见的就是桥本氏甲状腺炎，典型表现为甲状腺过氧化物酶抗体阳性，有淋巴滤泡结节生成也是它的比较典型的一个病理改变。除桥本氏甲状腺炎，临床上还可以见到无痛性甲状腺炎、萎缩性甲状腺炎以及产后甲状腺炎。这一大类自身免疫性甲状腺炎血中，都可以发现针对自身正常甲状腺组织所产生的一些抗体，像甲状腺球蛋白抗体、甲状腺过氧化物酶抗体以及甲状腺TSH受体抗体等等。自身免疫性甲状腺炎最终都会发展为甲减，但是有部分桥本氏甲状腺炎可以出现甲状腺毒症，特别是对于TSH刺激性抗体阳性患者，桥本氏甲亢时期可能比较长。