泌尿外科主要治疗泌尿系统的疾病，主要是指肾上腺、肾脏、输尿管、膀胱、尿道疾病，以及部分生殖系统疾病，比如睾丸、附睾、输精管、精囊、前列腺等器官的疾病，包括了以上器官和系统内的肿瘤、畸形、外伤、梗阻、感染等。梗阻类的疾病包括了泌尿系的结石、前列腺增生等。至于某些功能性的疾病目前分类比较细致分科比较多，比如肾脏疾病外科主要治疗器质性的病变，比如肾脏的结石、肿瘤、积水、感染等。如果是肾脏本身功能下降导致的肾衰竭，目前多在肾内科治疗，男性的早泄、勃起功能障碍等疾病，目前部分三甲医院则分到男科治疗。